Hola, yo he tenido algun problemilla parecido, sobre todo cuando pasaba las fotos usando un lector de tarjetas externo que compré en eBay, ya se sabe: lo barato a veces sale caro!
En fin, yo he usado este progrma
http://www.cgsecurity.org/wiki/PhotoRec_ES y normalmente me ha conseguido recuperar archivos de fotos "perdidas" o corruptas.
Ya dirás si lo has podido solucionar,
Saludos